Zagadki Globu Przyroda · Historia · Geografia

Przyroda

Enzym, który wiąże azot, niszczy tlen. Bobowate trzymają tlen w hemoglobinie

Azot to prawie 80 procent powietrza, a rośliny nie potrafią go użyć. Bobowate goszczą w korzeniach bakterie, które potrafią. Enzym wiążący azot niszczy jednak tlen, więc roślina trzyma go w hemoglobinie i barwi brodawki na różowo.

Zbliżenie na jasne korzenie koniczyny z drobnymi brodawkami, miejscami różowawymi, na tle ciemnej wilgotnej gleby

W powietrzu jest prawie 80 procent azotu, a roślina może w nim głodować. Ten azot występuje jako cząsteczka N2, w której dwa atomy trzymają się tak mocno, że większość organizmów nie potrafi ich rozdzielić[1]. Bobowate znalazły obejście: nie robią tego same, tylko goszczą bakterie, które potrafią, i płacą im cukrem. W korzeniach powstają z tego brodawki, a w nich białko łudząco podobne do hemoglobiny z naszej krwi, które barwi je na różowo. Bez niego cały układ się rozsypuje.

Azot, którego nie da się użyć

Cząsteczka N2 to dwa atomy azotu spojone potrójnym wiązaniem. W praktyce znaczy to, że azotu wokół jest pod dostatkiem, ale jest bezużyteczny: rośliny, zwierzęta i mikroorganizmy mogą umrzeć z niedoboru, otoczone gazem, którego nie potrafią wykorzystać. Do budowy aminokwasów i białek nadaje się amoniak, NH3, i właśnie jego brakuje. Przerobić N2 na amoniak umie tylko wąska grupa mikroorganizmów, wyposażona w enzym nitrogenazę.

Dla rolnika to nie ciekawostka, tylko rachunek. Azot jest składnikiem, który najczęściej ogranicza plon, a produkcja nawozów azotowych pochłania dużo energii, więc ich cena idzie za ceną paliw. Bobowate, czyli rodzina obejmująca groch, bobik, łubin, koniczynę, lucernę i soję, radzą sobie bez tego rachunku, przynajmniej częściowo: potrafią związać tyle azotu, ile potrzebują do wzrostu[2].

Grudka na korzeniu to mała fabryka

Zaczyna się od bakterii w glebie. Rhizobium wchodzi do korzenia, namnaża się w jego korze i wywołuje miejscowe zgrubienie, które po tygodniu widać już gołym okiem. W brodawce bakterie siedzą w komórkach rośliny i pracują: rozbijają N2 i oddają roślinie amoniak. Roślina daje im w zamian cukry z fotosyntezy oraz dach nad głową. To układ opłacalny dla obu stron, choć nie darmowy. Zupełnie inny interes prowadzi kanianka, pasożyt, który bierze od żywiciela i nie daje nic w zamian.

Liczba brodawek zależy od gatunku i od wielkości rośliny. Dorosła lucerna ma ich zwykle od 10 do 50, głównie przy korzeniu palowym. Soja potrafi mieć kilkaset, a orzeszek ziemny nawet ponad tysiąc. Grudki na roślinach jednorocznych są krótkotrwałe i wymieniane w ciągu sezonu; gdy zaczynają wypełniać się strąki, roślina przestaje je karmić i wiązanie azotu prawie ustaje, bo cukier idzie do nasion.

Nie każda brodawka pracuje. Bakterie z rodzaju Rhizobium dzielą się na gatunki i szczepy, a jeden gatunek obsługuje zwykle kilka spokrewnionych roślin. Jeśli w glebie brakuje właściwego szczepu, rolnik zaprawia nasiona preparatem z bakteriami, zwłaszcza gdy danej rośliny nie uprawiano tam od kilku lat. Bez tego powstają brodawki puste, a roślina pozostaje głodna. Po przekrojeniu widać różnicę: pracująca grudka jest różowa, nieczynna bieleje, szarzeje albo zielenieje i bywa przez roślinę porzucana.

Enzym, który nie znosi tlenu

Nitrogenaza jest jednym z najbardziej niezwykłych enzymów w przyrodzie i jednym z najbardziej kruchych. Rozbija potrójne wiązanie azotu, ale sama jest wrażliwa na tlen: w jego obecności traci zdolność do pracy[3]. Tymczasem rozbijanie N2 kosztuje ogromne ilości energii w postaci ATP, a ATP powstaje w oddychaniu tlenowym, czyli z udziałem tlenu. Bakteria potrzebuje więc tlenu, który niszczy jej główne narzędzie. John Innes Centre mówi wprost o paradoksie tlenowym wiązania azotu.

Hemoglobina w korzeniu

Rozwiązaniem jest specjalna hemoglobina, którą roślina produkuje w brodawce. Leghemoglobina należy do tej samej rodziny białek co hemoglobina w naszej krwi, wiąże tlen i jest czerwona, stąd różowy kolor aktywnej brodawki. Przekrój takiej grudki jest różowy lub czerwony, a biały, szary albo zielony oznacza, że wiązanie azotu ustało[4].

Leghemoglobina nie odcina jednak bakterii od tlenu. Działa jak bufor: występuje w komórce w stężeniu milimolowym, a stężenie wolnego tlenu spada przy niej do nanomoli. Bakteria dostaje tlen w dawce wystarczającej do oddychania, za małej jednak, by uszkodzić nitrogenazę, i dozowanej w miarę zużycia[5].

Skąd wiadomo, że to nie ozdoba

Do 2005 roku był to elegancki pomysł, którego nikt nie sprawdził w żywej roślinie. Zespół badaczy wyciszył w brodawkach rośliny modelowej, Lotus japonicus, geny leghemoglobiny. Skutek: wolny tlen w brodawce wzrósł, stosunek ATP do ADP spadł, białko nitrogenazy zniknęło, a wiązanie azotu ustało. Rośliny rosły jednak normalnie, gdy dostawały azot mineralny z zewnątrz. Dopiero to doświadczenie pokazało, że hemoglobina jest warunkiem wiązania azotu, a nie dodatkiem.

Cena i rachunek

Wiązanie azotu jest drogie. Roślina musi dostarczyć bakteriom cukier: dla wspięgi, znanej też jako cowpea, to około 3,1 miligrama węgla na miligram związanego azotu, a dla łubinu białego 6,6 miligrama. W szczycie sezonu soja potrafi wysłać do brodawek nawet połowę cukru z fotosyntezy. Nic dziwnego, że roślina woli azot z gleby, gdy tylko jest dostępny: nawożenie azotem hamuje tworzenie brodawek i wiązanie azotu.

Kto włącza hemoglobinę

W pracy opublikowanej w czasopiśmie Science zespół z CAS-JIC Centre of Excellence for Plant and Microbial Science opisał dwa czynniki transkrypcyjne, NIN i NLP2, które włączają geny leghemoglobiny. Rośliny pozbawione obu miały mniejsze i bledsze brodawki oraz mniej hemoglobiny, a wiązały mniej azotu. Spokrewnione z nimi białka regulują w roślinach odpowiedź na brak tlenu, co podpowiada, skąd taki mechanizm wziął się w symbiozie.

Z perspektywy rośliny brodawka jest kompromisem: wpuścić tlen do oddychania i jednocześnie trzymać go z dala od nitrogenazy. Hemoglobina rozwiązuje ten konflikt, ale nie usuwa kosztu. Dlatego bobowate nie wiążą azotu zawsze i nie wszystkie robią to równie dobrze. Fasola zwykła wypada słabo: wiąże mniej, niż potrzebuje, więc i ona potrzebuje azotu z zewnątrz.

Badacze z John Innes Centre opisują to jako krok do większego celu: gdyby udało się przenieść zdolność do tworzenia brodawek do zbóż, część nawożenia azotem stałaby się zbędna. Na razie to perspektywa badań, nie praktyka. W symbiozie nie wystarczy jeden gen, potrzebny jest cały układ, od bakterii w glebie po kontrolę tlenu w brodawce.

Źródła

  1. Robert Flynn, John Idowu, „Nitrogen Fixation by Legumes”, New Mexico State University, Guide A-129, zaktualizowany. https://pubs.nmsu.edu/_a/A129/
  2. Penn State Extension, „Inoculation of Forage and Grain Legumes”, aktualizacja 10 lutego 2025. https://extension.psu.edu/inoculation-of-forage-and-grain-legumes
  3. John Innes Centre, „How legumes give oxygen to symbiotic bacteria in their roots”. https://www.jic.ac.uk/press-release/how-legumes-give-oxygen-to-symbiotic-bacteria-in-their-roots/
  4. Cornell University, Department of Horticulture, „The basics of legume N fixation” (Organic Cropping Systems). http://www.hort.cornell.edu/extension/organic/ocs/tutorial/legume_n/1basics.htm
  5. T. Ott, J. T. van Dongen, C. Günther i in., „Symbiotic leghemoglobins are crucial for nitrogen fixation in legume root nodules but not for general plant growth and development”, Current Biology, 2005. https://doi.org/10.1016/j.cub.2005.01.042
  6. Zdjęcie: Rosser1954, „Root Nodules on White Clover”, Wikimedia Commons, licencja CC BY-SA 4.0. Kadr przycięty z 4608×3456 do 1920×1080 i przeskalowany do 1200×675; kadr rozpowszechniany na tej samej licencji. https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Root_Nodules_on_White_Clover.JPG

Pisze o przyrodzie, geografii i ciekawostkach. Zbiera pytania, które zaczynają się od „serio?”, i szuka na nie odpowiedzi w badaniach, a nie w łańcuszkach z internetu. Ma słabość do roślin, które robią rzeczy, jakich rośliny podobno nie robią.

Jak powstają nasze teksty